Casos

Idades

Comorbidades

Tempo do início dos sintomas

Raio X & tomografia

PCR

VHS

Dímero-D

PCR, VHS & Dímero-D

Município

Sinais clínicos

Linfócitos & neutrófilos

Igs

Carga viral

Valores-p

Teste-t de Welch de duas amostras, bicaudal (hipótese alternativa)
variável por média_não média_sim diferença conf.low conf.high n_não n_sim tstatistic p.value
tSintomas Internação 2.418 3.085 -0.667 -1.423 0.089 170 59 -1.754 0.083
PCR Internação 12.424 82.277 -69.853 -100.907 -38.799 29 48 -4.523 0.000
VHS Internação 14.833 24.667 -9.833 -20.930 1.263 6 21 -1.826 0.080
DímeroD Internação NA NA NA NA NA 1 39 NA NA
Linfócitos Internação 2994.550 2740.655 253.895 -618.776 1126.565 40 58 0.578 0.565
Neutrófilos Internação 3475.275 5501.293 -2026.018 -3666.922 -385.114 40 58 -2.452 0.016
N1N Internação 24.197 23.466 0.732 -1.505 2.968 185 43 0.655 0.515
N2ORF1ab Internação 22.104 21.865 0.238 -2.178 2.655 188 42 0.198 0.844
tSintomas UTI 2.500 3.476 -0.976 -2.494 0.541 208 21 -1.335 0.196
PCR UTI 40.678 106.089 -65.411 -122.010 -8.812 59 18 -2.391 0.025
VHS UTI 21.000 25.000 -4.000 -25.077 17.077 17 10 -0.415 0.686
DímeroD UTI 508.999 1914.929 -1405.930 -2777.716 -34.143 24 16 -2.172 0.045
Linfócitos UTI 3044.922 2108.619 936.303 -147.302 2019.908 77 21 1.762 0.088
Neutrófilos UTI 4631.494 4831.476 -199.983 -1995.954 1595.989 77 21 -0.224 0.824
N1N UTI 24.148 22.704 1.444 -2.140 5.029 214 14 0.861 0.403
N2ORF1ab UTI 22.028 22.512 -0.483 -4.678 3.712 215 15 -0.245 0.810
tSintomas VM 2.516 3.917 -1.401 -3.916 1.115 217 12 -1.221 0.247
PCR VM 48.662 99.809 -51.147 -110.301 8.007 66 11 -1.853 0.085
VHS VM 19.217 41.250 -22.033 -76.399 32.334 23 4 -1.243 0.297
DímeroD VM 902.550 1516.445 -613.896 -1855.153 627.361 29 11 -1.030 0.315
Linfócitos VM 3013.035 1634.917 1378.118 231.488 2524.748 86 12 2.543 0.021
Neutrófilos VM 4625.767 5022.500 -396.733 -2374.980 1581.515 86 12 -0.417 0.681
N1N VM 24.075 23.730 0.345 -4.384 5.074 218 10 0.163 0.874
N2ORF1ab VM 21.959 24.080 -2.121 -7.631 3.389 219 11 -0.851 0.414
tSintomas Comorbidade 2.454 3.130 -0.677 -1.584 0.231 183 46 -1.493 0.141
PCR Comorbidade 43.336 72.812 -29.476 -70.444 11.493 44 33 -1.435 0.156
VHS Comorbidade 20.067 25.500 -5.433 -22.700 11.834 15 12 -0.659 0.518
DímeroD Comorbidade 477.368 1467.373 -990.006 -1939.718 -40.293 16 24 -2.146 0.042
Linfócitos Comorbidade 3208.672 2243.541 965.132 106.102 1824.162 61 37 2.236 0.028
Neutrófilos Comorbidade 4401.754 5123.757 -722.003 -2571.145 1127.139 61 37 -0.777 0.439
N1N Comorbidade 24.290 22.829 1.461 -0.683 3.605 192 36 1.370 0.177
N2ORF1ab Comorbidade 21.997 22.379 -0.382 -2.774 2.010 192 38 -0.321 0.750

Modelo preditivo

Internação

Penalized (LASSO) logistic regression

# A tibble: 1 x 2
  penalty .config              
    <dbl> <chr>                
1  0.0117 Preprocessor1_Model21
# A tibble: 1 x 7
  penalty .metric .estimator  mean     n std_err .config              
    <dbl> <chr>   <chr>      <dbl> <int>   <dbl> <chr>                
1  0.0386 roc_auc binary     0.981    15 0.00799 Preprocessor1_Model26

Random forest (tree-based ensemble)

UTI

Penalized (LASSO) logistic regression

# A tibble: 1 x 2
  penalty .config              
    <dbl> <chr>                
1  0.0489 Preprocessor1_Model27
# A tibble: 1 x 7
  penalty .metric .estimator  mean     n std_err .config              
    <dbl> <chr>   <chr>      <dbl> <int>   <dbl> <chr>                
1  0.0304 roc_auc binary     0.963    11  0.0163 Preprocessor1_Model25

Random forrest (tree-based ensemble)

VM

Penalized (LASSO) logistic regression

# A tibble: 1 x 2
  penalty .config              
    <dbl> <chr>                
1 0.00174 Preprocessor1_Model13
# A tibble: 1 x 7
  penalty .metric .estimator  mean     n std_err .config              
    <dbl> <chr>   <chr>      <dbl> <int>   <dbl> <chr>                
1  0.0304 roc_auc binary     0.871     8  0.0554 Preprocessor1_Model25

Random forrest (tree-based ensemble)

Matrizes de confusão

Penalized (LASSO) logistic regression

Random forest (tree-based ensemble)